王小凡教授在细胞信号转导、DNA损伤与修复、肿瘤微环境等多个肿瘤相关领域均有重要建树。他首先克隆了TGF-βIII型和II型受体,是TGF-β研究领域极为重要的发现,并对TGF-β后来的研究产生了深远的影响。他继而对TGF-β及其介导的下游信号通路进行了深入系统的研究,发现多个重要的调控因子及其相关机制。包括最近发现 特定的 microRNA分子和分泌蛋白作为TGF-β信号转导的中间载体而影响肿瘤微环境的分子机制。王小凡教授在TGF-β相关研究领域先后发表了130 多篇论文,其中在《Cell》,《Nature》,《Science》,《Genes & Dev》,《PNAS》等高水平杂志上发表20 余篇。从2006年起,他开始担任国际上有重大影响的《生物化学期刊》(Journal of Biological Chemistry)的副主编,是JBC建刊百余年来的第一位亚裔副主编。在他担任副主编期间,介绍和推荐了几十位中国科技界领军人物,包括两院院士,先后进入《生物化学期刊》(Journal of Biological Chemistry)编委会,为扩大中国籍科学家在世界的影响做出了巨大贡献。
从2007年起他被聘请为中国国务院侨办海外专家咨询委员会委员,并于2010年起被聘任为科技部重大科学计划专家组成员,从而直接参与了对科研计划评审过程中相关问题的许多改革工作。为了帮助建立一个学术专家主导的科研评估体系,从2008年开始由王小凡教授组织国际专家团队,对中国科学院生命科学领域十多个研究所以及清华大学生命科学院、上海交通大学生命科学院与基础医学院,复旦大学医学院,北京大学生命科学院,浙江大学生命科学研究院等大学学院,和中国医学科学院进行了一系列的国际评估,为推动我国科研评价体制的改革做出了重要贡献。